All Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 plasmid pRAF

Total Repeats: 288

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_012634GGT2625300 %33.33 %66.67 %0 %228478452
2NC_012634ATA26414666.67 %33.33 %0 %0 %228478452
3NC_012634CTT2656610 %66.67 %0 %33.33 %228478452
4NC_012634AT3611011550 %50 %0 %0 %228478452
5NC_012634CAT2618519033.33 %33.33 %0 %33.33 %228478452
6NC_012634CTT262212260 %66.67 %0 %33.33 %228478452
7NC_012634CTTAC21023624520 %40 %0 %40 %228478452
8NC_012634TCA2625526033.33 %33.33 %0 %33.33 %228478452
9NC_012634CTA2629630133.33 %33.33 %0 %33.33 %228478452
10NC_012634CTG263373420 %33.33 %33.33 %33.33 %228478452
11NC_012634AGA2635235766.67 %0 %33.33 %0 %228478452
12NC_012634AAG2636036566.67 %0 %33.33 %0 %228478452
13NC_012634TAA2638438966.67 %33.33 %0 %0 %228478452
14NC_012634CTA2644044533.33 %33.33 %0 %33.33 %228478452
15NC_012634AGTA2845346050 %25 %25 %0 %228478452
16NC_012634AAT2655956466.67 %33.33 %0 %0 %228478452
17NC_012634TTC265865910 %66.67 %0 %33.33 %228478452
18NC_012634TAT2660060533.33 %66.67 %0 %0 %228478452
19NC_012634CTTT286526590 %75 %0 %25 %228478452
20NC_012634ACA2668468966.67 %0 %0 %33.33 %228478452
21NC_012634AT3671972450 %50 %0 %0 %228478452
22NC_012634AT3672973450 %50 %0 %0 %228478452
23NC_012634ACA2673874366.67 %0 %0 %33.33 %228478452
24NC_012634CTT267537580 %66.67 %0 %33.33 %228478452
25NC_012634TGA2678979433.33 %33.33 %33.33 %0 %228478452
26NC_012634AT3683083550 %50 %0 %0 %228478452
27NC_012634AGA2688589066.67 %0 %33.33 %0 %228478452
28NC_012634TAA2692492966.67 %33.33 %0 %0 %228478452
29NC_012634CT369309350 %50 %0 %50 %228478452
30NC_012634AG3696496950 %0 %50 %0 %228478452
31NC_012634A77977983100 %0 %0 %0 %228478452
32NC_012634A779991005100 %0 %0 %0 %228478452
33NC_012634TAA391014102266.67 %33.33 %0 %0 %228478452
34NC_012634AGA261023102866.67 %0 %33.33 %0 %228478452
35NC_012634AAT261029103466.67 %33.33 %0 %0 %228478452
36NC_012634TA361063106850 %50 %0 %0 %228478452
37NC_012634A6611351140100 %0 %0 %0 %228478452
38NC_012634T66114411490 %100 %0 %0 %228478452
39NC_012634TTC26119111960 %66.67 %0 %33.33 %228478452
40NC_012634T66119712020 %100 %0 %0 %228478452
41NC_012634TAG391212122033.33 %33.33 %33.33 %0 %228478452
42NC_012634ACA261223122866.67 %0 %0 %33.33 %228478452
43NC_012634TAA261335134066.67 %33.33 %0 %0 %228478452
44NC_012634TTA261354135933.33 %66.67 %0 %0 %228478452
45NC_012634ACTT281517152425 %50 %0 %25 %228478452
46NC_012634GAA261590159566.67 %0 %33.33 %0 %228478452
47NC_012634ATA391664167266.67 %33.33 %0 %0 %228478452
48NC_012634AAT261686169166.67 %33.33 %0 %0 %228478452
49NC_012634G66171117160 %0 %100 %0 %228478452
50NC_012634AGCG281735174225 %0 %50 %25 %228478452
51NC_012634TAT261795180033.33 %66.67 %0 %0 %228478452
52NC_012634CTG26182618310 %33.33 %33.33 %33.33 %228478452
53NC_012634GAAA281852185975 %0 %25 %0 %228478452
54NC_012634AGA261860186566.67 %0 %33.33 %0 %228478452
55NC_012634ATT261903190833.33 %66.67 %0 %0 %228478452
56NC_012634AGA261962196766.67 %0 %33.33 %0 %228478452
57NC_012634AATCA2101981199060 %20 %0 %20 %228478452
58NC_012634GA362001200650 %0 %50 %0 %228478452
59NC_012634GGTTT210203120400 %60 %40 %0 %228478452
60NC_012634CAA262096210166.67 %0 %0 %33.33 %228478452
61NC_012634ATT262129213433.33 %66.67 %0 %0 %228478452
62NC_012634TATGAA2122185219650 %33.33 %16.67 %0 %228478452
63NC_012634TAT262210221533.33 %66.67 %0 %0 %228478452
64NC_012634TGA262301230633.33 %33.33 %33.33 %0 %228478453
65NC_012634ATGATA2122323233450 %33.33 %16.67 %0 %228478453
66NC_012634AAG262368237366.67 %0 %33.33 %0 %228478453
67NC_012634GAT262440244533.33 %33.33 %33.33 %0 %228478453
68NC_012634ACA262490249566.67 %0 %0 %33.33 %228478453
69NC_012634GAA262524252966.67 %0 %33.33 %0 %228478453
70NC_012634A6625282533100 %0 %0 %0 %228478453
71NC_012634TCT26256025650 %66.67 %0 %33.33 %228478453
72NC_012634AAT262593259866.67 %33.33 %0 %0 %228478453
73NC_012634TAA262666267166.67 %33.33 %0 %0 %228478453
74NC_012634A7726702676100 %0 %0 %0 %228478453
75NC_012634TAG262682268733.33 %33.33 %33.33 %0 %228478453
76NC_012634AAGGAA2122698270966.67 %0 %33.33 %0 %228478453
77NC_012634TAA262733273866.67 %33.33 %0 %0 %228478453
78NC_012634A6627662771100 %0 %0 %0 %228478453
79NC_012634AT362779278450 %50 %0 %0 %228478453
80NC_012634A6628172822100 %0 %0 %0 %228478453
81NC_012634TTA262830283533.33 %66.67 %0 %0 %228478453
82NC_012634AAAG282857286475 %0 %25 %0 %228478453
83NC_012634TAA262886289166.67 %33.33 %0 %0 %228478453
84NC_012634A6628932898100 %0 %0 %0 %228478453
85NC_012634ACA262928293366.67 %0 %0 %33.33 %228478453
86NC_012634TAG262955296033.33 %33.33 %33.33 %0 %228478453
87NC_012634GTAA282961296850 %25 %25 %0 %228478453
88NC_012634ATC263168317333.33 %33.33 %0 %33.33 %228478454
89NC_012634A7732033209100 %0 %0 %0 %228478454
90NC_012634A6632193224100 %0 %0 %0 %228478454
91NC_012634GCAG283256326325 %0 %50 %25 %228478454
92NC_012634AAT263337334266.67 %33.33 %0 %0 %228478454
93NC_012634GAG263362336733.33 %0 %66.67 %0 %228478454
94NC_012634A7733683374100 %0 %0 %0 %228478454
95NC_012634CAG263414341933.33 %0 %33.33 %33.33 %228478454
96NC_012634TTTC28343034370 %75 %0 %25 %228478454
97NC_012634GCA263446345133.33 %0 %33.33 %33.33 %228478454
98NC_012634GA363468347350 %0 %50 %0 %228478454
99NC_012634TGG26352935340 %33.33 %66.67 %0 %228478454
100NC_012634A6635583563100 %0 %0 %0 %228478454
101NC_012634TAGG283639364625 %25 %50 %0 %228478454
102NC_012634TCC26366736720 %33.33 %0 %66.67 %228478454
103NC_012634TTA263875388033.33 %66.67 %0 %0 %228478455
104NC_012634AG363910391550 %0 %50 %0 %228478455
105NC_012634ATT263949395433.33 %66.67 %0 %0 %228478455
106NC_012634TCA264061406633.33 %33.33 %0 %33.33 %228478455
107NC_012634AT364067407250 %50 %0 %0 %228478455
108NC_012634CTC26409641010 %33.33 %0 %66.67 %228478455
109NC_012634TCT26410641110 %66.67 %0 %33.33 %228478455
110NC_012634T77411141170 %100 %0 %0 %228478455
111NC_012634AATGTA2124198420950 %33.33 %16.67 %0 %228478455
112NC_012634TAC264233423833.33 %33.33 %0 %33.33 %228478455
113NC_012634CAT264312431733.33 %33.33 %0 %33.33 %228478455
114NC_012634TCA394343435133.33 %33.33 %0 %33.33 %228478455
115NC_012634CAA264368437366.67 %0 %0 %33.33 %228478455
116NC_012634TCA264382438733.33 %33.33 %0 %33.33 %228478455
117NC_012634CAT264390439533.33 %33.33 %0 %33.33 %228478455
118NC_012634TAC264471447633.33 %33.33 %0 %33.33 %228478455
119NC_012634TTG26470147060 %66.67 %33.33 %0 %228478456
120NC_012634GAA264732473766.67 %0 %33.33 %0 %228478456
121NC_012634TGA264751475633.33 %33.33 %33.33 %0 %228478456
122NC_012634TCA264821482633.33 %33.33 %0 %33.33 %228478456
123NC_012634AT364827483250 %50 %0 %0 %228478456
124NC_012634CTC26485648610 %33.33 %0 %66.67 %228478456
125NC_012634TCT26486648710 %66.67 %0 %33.33 %228478456
126NC_012634T77487148770 %100 %0 %0 %228478456
127NC_012634AATGTA2124958496950 %33.33 %16.67 %0 %228478456
128NC_012634TAC264993499833.33 %33.33 %0 %33.33 %228478456
129NC_012634CAT265072507733.33 %33.33 %0 %33.33 %228478456
130NC_012634TCA395103511133.33 %33.33 %0 %33.33 %228478456
131NC_012634CAA265128513366.67 %0 %0 %33.33 %228478456
132NC_012634TCA265142514733.33 %33.33 %0 %33.33 %228478456
133NC_012634CAT265150515533.33 %33.33 %0 %33.33 %228478456
134NC_012634TAC265231523633.33 %33.33 %0 %33.33 %228478456
135NC_012634TCTTTT212526552760 %83.33 %0 %16.67 %228478456
136NC_012634TTATTG2125289530016.67 %66.67 %16.67 %0 %228478456
137NC_012634ATA265320532566.67 %33.33 %0 %0 %228478456
138NC_012634GCA265326533133.33 %0 %33.33 %33.33 %228478456
139NC_012634CTA265367537233.33 %33.33 %0 %33.33 %228478456
140NC_012634TACGTA2125390540133.33 %33.33 %16.67 %16.67 %228478456
141NC_012634T66542254270 %100 %0 %0 %228478456
142NC_012634AGT265429543433.33 %33.33 %33.33 %0 %228478456
143NC_012634T66545454590 %100 %0 %0 %228478456
144NC_012634TCTT28549154980 %75 %0 %25 %228478456
145NC_012634AAT265575558066.67 %33.33 %0 %0 %228478456
146NC_012634AGC265597560233.33 %0 %33.33 %33.33 %228478456
147NC_012634TCA265634563933.33 %33.33 %0 %33.33 %228478456
148NC_012634CTA265664566933.33 %33.33 %0 %33.33 %228478456
149NC_012634CTTT28570057070 %75 %0 %25 %228478456
150NC_012634GT36574357480 %50 %50 %0 %228478456
151NC_012634TGT26575257570 %66.67 %33.33 %0 %228478456
152NC_012634CTAA285851585850 %25 %0 %25 %228478457
153NC_012634TAGT285911591825 %50 %25 %0 %228478457
154NC_012634TAAT285950595750 %50 %0 %0 %228478457
155NC_012634ACA265961596666.67 %0 %0 %33.33 %228478457
156NC_012634AGAA285974598175 %0 %25 %0 %228478457
157NC_012634AAGA286015602275 %0 %25 %0 %228478457
158NC_012634AAT266032603766.67 %33.33 %0 %0 %228478457
159NC_012634TGT26604260470 %66.67 %33.33 %0 %228478457
160NC_012634ATAG286081608850 %25 %25 %0 %228478457
161NC_012634TTCT28616861750 %75 %0 %25 %228478457
162NC_012634TAA266188619366.67 %33.33 %0 %0 %228478457
163NC_012634ATA266202620766.67 %33.33 %0 %0 %228478457
164NC_012634ATT266239624433.33 %66.67 %0 %0 %228478458
165NC_012634TTA266270627533.33 %66.67 %0 %0 %228478458
166NC_012634TAA266295630066.67 %33.33 %0 %0 %228478458
167NC_012634TAT266313631833.33 %66.67 %0 %0 %228478458
168NC_012634TTA266321632633.33 %66.67 %0 %0 %228478458
169NC_012634CAG266373637833.33 %0 %33.33 %33.33 %228478458
170NC_012634TTA266384638933.33 %66.67 %0 %0 %228478458
171NC_012634TCT26640564100 %66.67 %0 %33.33 %228478458
172NC_012634TTAG286417642425 %50 %25 %0 %228478458
173NC_012634GTT26647264770 %66.67 %33.33 %0 %228478458
174NC_012634CCT26726372680 %33.33 %0 %66.67 %228478459
175NC_012634AATG287320732750 %25 %25 %0 %228478459
176NC_012634A6674077412100 %0 %0 %0 %228478459
177NC_012634TC36760076050 %50 %0 %50 %228478459
178NC_012634AT487625763250 %50 %0 %0 %228478459
179NC_012634GTA267965797033.33 %33.33 %33.33 %0 %228478460
180NC_012634TGAA287979798650 %25 %25 %0 %228478460
181NC_012634TTC26800980140 %66.67 %0 %33.33 %228478460
182NC_012634TC36801380180 %50 %0 %50 %228478460
183NC_012634TTG26805180560 %66.67 %33.33 %0 %228478460
184NC_012634TAC268063806833.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
185NC_012634CTG26809881030 %33.33 %33.33 %33.33 %228478460
186NC_012634ACTT288184819125 %50 %0 %25 %228478460
187NC_012634T66829883030 %100 %0 %0 %228478460
188NC_012634CTG26831883230 %33.33 %33.33 %33.33 %228478460
189NC_012634AT368381838650 %50 %0 %0 %228478460
190NC_012634GCT26841884230 %33.33 %33.33 %33.33 %228478460
191NC_012634CTTGAT2128444845516.67 %50 %16.67 %16.67 %228478460
192NC_012634CTA268551855633.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
193NC_012634TGTT28858485910 %75 %25 %0 %228478460
194NC_012634ACT268607861233.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
195NC_012634T66863386380 %100 %0 %0 %228478460
196NC_012634CAT268645865033.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
197NC_012634TCA398656866433.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
198NC_012634GCTA288667867425 %25 %25 %25 %228478460
199NC_012634CAG398675868333.33 %0 %33.33 %33.33 %228478460
200NC_012634TAC268843884833.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
201NC_012634TAG268855886033.33 %33.33 %33.33 %0 %228478460
202NC_012634TTC26893189360 %66.67 %0 %33.33 %228478460
203NC_012634CTG26896689710 %33.33 %33.33 %33.33 %228478460
204NC_012634CT36903690410 %50 %0 %50 %228478460
205NC_012634ATG269043904833.33 %33.33 %33.33 %0 %228478460
206NC_012634TCT26906290670 %66.67 %0 %33.33 %228478460
207NC_012634TCG26910391080 %33.33 %33.33 %33.33 %228478460
208NC_012634CTA269109911433.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
209NC_012634CACTAC2129128913933.33 %16.67 %0 %50 %228478460
210NC_012634TACA289143915050 %25 %0 %25 %228478460
211NC_012634CAC269185919033.33 %0 %0 %66.67 %228478460
212NC_012634ATC269195920033.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
213NC_012634TCT26923592400 %66.67 %0 %33.33 %228478460
214NC_012634TTC26927092750 %66.67 %0 %33.33 %228478460
215NC_012634TCT26929292970 %66.67 %0 %33.33 %228478460
216NC_012634TCT26931093150 %66.67 %0 %33.33 %228478460
217NC_012634ACT269318932333.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
218NC_012634GGT26933793420 %33.33 %66.67 %0 %228478460
219NC_012634TA369478948350 %50 %0 %0 %228478460
220NC_012634CTC26949494990 %33.33 %0 %66.67 %228478460
221NC_012634ATT269519952433.33 %66.67 %0 %0 %228478460
222NC_012634T66953595400 %100 %0 %0 %228478460
223NC_012634GCT26954295470 %33.33 %33.33 %33.33 %228478460
224NC_012634CT36954695510 %50 %0 %50 %228478460
225NC_012634TGT26958795920 %66.67 %33.33 %0 %228478460
226NC_012634CTT39969497020 %66.67 %0 %33.33 %228478460
227NC_012634TGCT28972997360 %50 %25 %25 %228478460
228NC_012634TAC269765977033.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
229NC_012634TTC26979097950 %66.67 %0 %33.33 %228478460
230NC_012634TC36979497990 %50 %0 %50 %228478460
231NC_012634TCT39981398210 %66.67 %0 %33.33 %228478460
232NC_012634CT48988898950 %50 %0 %50 %228478460
233NC_012634T66990199060 %100 %0 %0 %228478460
234NC_012634CAC269980998533.33 %0 %0 %66.67 %228478460
235NC_012634TGA269986999133.33 %33.33 %33.33 %0 %228478460
236NC_012634GGA26100241002933.33 %0 %66.67 %0 %228478460
237NC_012634TGG2610032100370 %33.33 %66.67 %0 %228478460
238NC_012634TGG2610056100610 %33.33 %66.67 %0 %228478460
239NC_012634A661010510110100 %0 %0 %0 %228478460
240NC_012634ATTAAG212102271023850 %33.33 %16.67 %0 %228478460
241NC_012634CTT2610251102560 %66.67 %0 %33.33 %228478460
242NC_012634TAG26102611026633.33 %33.33 %33.33 %0 %228478460
243NC_012634CTA39102761028433.33 %33.33 %0 %33.33 %228478460
244NC_012634AGT26102921029733.33 %33.33 %33.33 %0 %228478460
245NC_012634CT3610348103530 %50 %0 %50 %228478460
246NC_012634TTG2610387103920 %66.67 %33.33 %0 %228478460
247NC_012634AT36104051041050 %50 %0 %0 %228478460
248NC_012634ATA26104201042566.67 %33.33 %0 %0 %228478460
249NC_012634TTA26106471065233.33 %66.67 %0 %0 %228478461
250NC_012634ATT26106871069233.33 %66.67 %0 %0 %228478461
251NC_012634CTT2610713107180 %66.67 %0 %33.33 %228478461
252NC_012634TGA26107621076733.33 %33.33 %33.33 %0 %228478461
253NC_012634TA36107871079250 %50 %0 %0 %228478461
254NC_012634GAT26107961080133.33 %33.33 %33.33 %0 %228478461
255NC_012634AT36108101081550 %50 %0 %0 %228478461
256NC_012634AAC26108411084666.67 %0 %0 %33.33 %228478461
257NC_012634ATA26108811088666.67 %33.33 %0 %0 %228478461
258NC_012634GCT2610904109090 %33.33 %33.33 %33.33 %228478461
259NC_012634A771094810954100 %0 %0 %0 %228478461
260NC_012634ATG26109561096133.33 %33.33 %33.33 %0 %228478461
261NC_012634AT36109881099350 %50 %0 %0 %228478461
262NC_012634T6611006110110 %100 %0 %0 %228478461
263NC_012634TAG26110451105033.33 %33.33 %33.33 %0 %228478461
264NC_012634TTC2611227112320 %66.67 %0 %33.33 %228478462
265NC_012634T9911281112890 %100 %0 %0 %228478462
266NC_012634AGC26113451135033.33 %0 %33.33 %33.33 %228478462
267NC_012634TAT26113531135833.33 %66.67 %0 %0 %228478462
268NC_012634TTC2611374113790 %66.67 %0 %33.33 %228478462
269NC_012634AT36113991140450 %50 %0 %0 %228478462
270NC_012634T6611442114470 %100 %0 %0 %228478462
271NC_012634TAG26114501145533.33 %33.33 %33.33 %0 %228478462
272NC_012634TTC2611528115330 %66.67 %0 %33.33 %228478462
273NC_012634TAT26115341153933.33 %66.67 %0 %0 %228478462
274NC_012634ATT26116281163333.33 %66.67 %0 %0 %228478462
275NC_012634TGG2611645116500 %33.33 %66.67 %0 %228478462
276NC_012634TAA26116591166466.67 %33.33 %0 %0 %228478462
277NC_012634TATT28116801168725 %75 %0 %0 %228478462
278NC_012634TTA26116891169433.33 %66.67 %0 %0 %228478462
279NC_012634AT36117341173950 %50 %0 %0 %228478462
280NC_012634T6611752117570 %100 %0 %0 %228478462
281NC_012634CCA26117591176433.33 %0 %0 %66.67 %228478462
282NC_012634TGT2611778117830 %66.67 %33.33 %0 %228478462
283NC_012634CTT2611807118120 %66.67 %0 %33.33 %228478462
284NC_012634T6611817118220 %100 %0 %0 %228478462
285NC_012634TTGC2811829118360 %50 %25 %25 %228478462
286NC_012634TTG2611851118560 %66.67 %33.33 %0 %228478462
287NC_012634CTC2611866118710 %33.33 %0 %66.67 %228478462
288NC_012634AGC26118791188433.33 %0 %33.33 %33.33 %228478462